男性性功能障礙，通常第一個想到的科別就是泌尿科；然而，許多時候復健科也能在許多層面上與泌尿科一同合作，讓患者得到更完善的治療：
- 骨盆底肌訓練：和其他肌肉一樣，治療性的訓練可以讓骨盆肌肉更協調的收縮，進而改善功能。
- 口服藥物治療：口服第5型磷酸二脂酶抑制劑（簡稱PDE5-I）可依劑型而有每天使用、一週2～3次或需要時使用等的不同療程，目前研究認為如何挑選並沒特別的差異性。一般而言，藥物使用為最方便也最常使用的方式，可有效協助患者在性愛過程中，維持足夠的陰莖勃起。
- 真空吸引負壓助勃器：把助勃器外管套在陰莖上，利用負壓作用被動式的讓陰莖血流量增加，進而達到復健目的。通常都是在口服藥物效果不佳時才考慮採用。考慮到可能有過度充血損傷或疼痛等副作用，因此需要醫師評估後才可購買及使用。
- 陰莖海綿體注射治療：在陰莖海綿體上注射前列腺素（PGE1）也是勃起障礙治療方式之一，但打針相對侵入性較大且疼痛，一般人接受程度比較不高。
- 低能量體外震波治療：為最新勃起功能障礙治療方式，歐洲泌尿科醫學會也於2014年將低能量體外震波列為治療勃起功能障礙的第一線可選擇治療，甚至以此治療來取代過去第一線的口服藥物治療。而在台灣，衛生福利部於2015年開始核可使用低能量體外震波治療勃起功能障礙。此治療利用低能量體外震波設備之探頭，發出低能量震波針對陰莖海線體或會陰部進行治療，剌激陰莖海線體或骨盆腔內產生血管新生，改善局部血流循環，讓缺氧的軟組織恢復血液供給，進而使勃起功能改善及增加勃起硬度。
- 植入人工陰莖：因手術風險所造成的器質性勃起障礙患者，如果前幾項治療方式都未能獲得明顯效果，則可透過人工陰莖植入手術，以人工陰莖取代原有的海綿體改善勃起功能。